A. Monografie
(con José Pedro Paiva) História da Inquisição Portuguesa, 1536-1821 (Lisboa: Esfera dos Livros, 2013) (in preparazione)
A consciência de um império. Portugal e o seu mundo (sécs. XV-XVII) (Coimbra: Imprensa da Universidade de Coimbra, 2012), 534 pp.
L’invenzione di un impero: Politica e cultura nel mondo portoghese, 1450-1600 (Roma: Carocci, 2011), 192 pp.
I custodi dell’ortodossia: Inquisizione e Chiesa nel Portogallo del Cinquecento (Roma: Edizioni di Storia e Letteratura, 2004), 370 pp.
B. Curatela di volumi
(con Wietse De Boer, Aliocha Maldavsky e Ilaria Pavan) Space and Conversion: A Global Approach (Leiden; Boston: Brill, 2013) (in preparazione)
Società ostili. Stereotipi, giustizia, integrazione (secoli XVI-XVIII), dossier in Società e Storia 138 (2012) 729-822
(con Massimo Donattini e Stefania Pastore) L’Europa divisa e i Nuovi Mondi: Per Adriano Prosperi, vol. 2 (Pisa: Edizioni della Normale, 2011), 470 pp.
C. Articoli in rivista
“Tra cristianesimo e Islam. Le vite parallele degli schiavi abissini in India (secoli XVI-XVII),” in Società ostili. Stereotipi, giustizia, integrazione (secoli XVI-XVIII), a cura di Giuseppe Marcocci, Società e Storia 138 (2012) 807-822
"Premessa," in Società ostili. Stereotipi, giustizia, integrazione (secoli XVI-XVIII), a cura di Giuseppe Marcocci, Società e Storia 138 (2012) 729-734
“A fé de um império: a Inquisição no mundo português de Quinhentos,” Revista de História (Universidade de São Paulo) 164 (2011) 65-100
“Escravos ameríndios e negros africanos: uma história conectada. Teorias e modelos de discriminação no império português (ca. 1450-1650),” Tempo (Universidade Federal Fluminense) 30 (2011) 41-70
“A fundação da Inquisição em Portugal: um novo olhar,” Lusitania Sacra s. 2, 23 (2011) 17-40
“Contro i falsari: Gaspar Barreiros censore di Annio da Viterbo,” Rinascimento 50 (2010) 343-359
“Toward a History of the Portuguese Inquisition: Trends in Modern Historiography (1974-2009),” Revue de l’histoire des religions 227 (2010) 355-93
“Teologia e missioni in un impero commerciale: casi di coscienza e sacramenti nell’Asia portoghese, 1550-1600 ca.,” Cristianesimo nella storia 31 (2010) 451-82
“Costruire un ‘outro Portugal’. Strategie di conversione a Goa tra Cinque e Seicento,” Rivista di Storia del Cristianesimo 7 (2010) 23-34
“Matrimoni omosessuali nella Roma del tardo Cinquecento. Su un passo del ‘Journal’ di Montaigne,” Quaderni Storici 132 (2010) 107-38
“O arcebispo de Braga D. Frei Bartolomeu dos Mártires (1559-1582). Um caso de inquisição pastoral?,” Revista de História da Sociedade e da Cultura 9 (2009) 119-46
“Machiavelli, la religione dei romani e l’impero portoghese,” Storica 41-2 (2008) 35-68
“A Inquisição portuguesa sob acusação: o protesto internacional de Gastão de Abrunhosa (1602-1607),” Cadernos de Estudos Sefarditas 7 (2007) 31-81 (anche in italiano: “Questioni di stile: Gastão de Abrunhosa contro l’Inquisizione portoghese (1602-1607),” Studi storici 48 (2007) 779-815)
“Pierre Bayle e la storiografia confessionale. Gli eretici italiani del Cinquecento nel ‘Dictionnaire historique et critique’,” Rivista di storia e letteratura religiosa 43 (2007) 599-623
“Gli umanisti italiani e l’impero portoghese: una interpretazione della ‘Fides, Religio Moresque Æthiopum’ di Damião de Góis,” Rinascimento 45 (2005) 307-66 (ora anche in Traduzioni, imitazioni, scambi tra Italia e Portogallo nei secoli, a cura di Monica Lupetti (Firenze: Olschki, 2008) 61-124)
“Ebrei e utopia nel secolo dei Lumi. Una lettura del capitolo LXXIX de ‘L’An 2440’ di Louis-Sébastien Mercier,” Rivista di storia e letteratura religiosa 41 (2005) 355-88
“Inquisição, jesuítas e cristãos-novos em Portugal no século XVI,” Revista de História das Ideias (Universidade de Coimbra) 25 (2004) 247-326
“Il governo dell’arcidiocesi di Braga al tempo di Bartolomeu dos Mártires (1559-1582). Riflessioni e documenti sull’episcopato portoghese nell’età del concilio di Trento,” Archivio italiano per la storia della pietà 15 (2002) 81-150
D. Capitoli in libro
“Rites and Inquisition: Ethnography of Errors in Portuguese India (1560-1625),”, in The Rites Controversy in the Early Modern World, ed. by Pierre-Antoine Fabre and Ines G. Zupanov (in corso di stampa)
“Trading with Muslims: Religious Limits and Proscription in the Portuguese Empire (c. 1500-70),” in Religion and Trade: Cross-Cultural Exchanges in World History, 1000-1900, ed. by Cátia Antunes, Leor Halevi and Francesca Trivellato (Honolulu: Hawai’i University Press, 2013) (in corso di stampa)
“A evolução dos rituais das Misericórdias (1498-1910),” in Portugaliae Monumenta Misericordiarum, dir. José Pedro Paiva, vol. 10 (Lisboa: União das Misericórdias Portuguesas, 2013) (in corso di stampa)
“Prism of Empire: the Shifting Image of Ethiopia in Renaissance Portugal (1500-1575),” in Portuguese Humanism and the Republic of Letters, ed. by Maria Berbara and Karl Enenkel (Leiden; Boston: Brill, 2012) 447-64
““Hanno con tutto ciò nelle occorrenze ubbidito”: l’Inquisizione portoghese nelle carte della Congregazione del Sant’Uffizio (1555-1821)”, in Gli archivi della Santa Sede come fonte per la storia del Portogallo in età moderna. Studi in memoria di Carmen Radulet, a cura di Giovanni Pizzorusso, Gaetano Platania e Matteo Sanfilippo (Viterbo: Sette Città, 2012) 121-138
“L’ordine cristiano e il mondo. Francisco de Támara traduttore di Hans Böhm, ”, in L’Europa divisa e i nuovi mondi: Per Adriano Prosperi, vol. 2, a cura di Massimo Donattini, Giuseppe Marcocci e Stefania Pastore (Pisa: Edizioni della Normale, 2011) 79-92
“Conversione e schiavitù. La confraternita della ‘Nossa Senhora do Rosário’ nella Lisbona del Cinquecento,” in Brotherhood and Boundaries. Fraternità e barriere, a cura di Adriano Prosperi, Nicholas Terpstra and Stefania Pastore (Pisa: Edizioni della Normale, 2011) 367-85
“Itinerari marrani. I portoghesi a Livorno nei secoli dell’età moderna,” in Livorno 1606-1806. Luogo di incontro tra popoli e culture, a cura di Adriano Prosperi (Torino: Allemandi, 2009) 341-53
“Gli umanisti italiani e l’impero portoghese: una interpretazione della ‘Fides, Religio Moresque Æthiopum’ di Damião de Góis,” in Traduzioni, imitazioni, scambi tra Italia e Portogallo nei secoli, a cura di Monica Lupetti (Firenze: Olschki, 2008) 61-124 (già in Rinascimento 45 (2005) 307-66)
“La salvezza dei condannati a morte. Giustizia, conversioni e sacramenti in Portogallo e nel suo impero. 1450-1700 ca.,” in Misericordie. Conversioni sotto il patibolo tra Medioevo ed età moderna, a cura di Adriano Prosperi (Pisa: Edizioni della Normale, 2007) 189-255
“A proposito dell’immagine dell’Italia nel Cinquecento. La ‘Descrittione di tutta Italia’ di Leandro Alberti e la cartografia rinascimentale,” in L’Italia dell’inquisitore. Storia e geografia dell’Italia del Cinquecento nella ‘Descrittione’ di Leandro Alberti, a cura di Massimo Donattini (Bologna: Bononia University Press, 2007) 273-98
“«… per capillos adductos ad pillam». Il dibattito cinquecentesco sulla validità del battesimo forzato degli ebrei in Portogallo (1496-1497),” in Salvezza delle anime, disciplina dei corpi. Un seminario sulla storia del battesimo, a cura di Adriano Prosperi (Pisa: Edizioni della Normale, 2006) 339-423
“‘Catequização pelo medo’? Inquisitori, vescovi e confessori di fronte ai nuovi cristiani nel Portogallo del Cinquecento.” In Le inquisizioni cristiane e gli Ebrei (Roma: Atti dei Convegni Lincei, 2003) 123-93
E. Altre pubblicazioni
Recensione di Ricardo García Cárcel, La herencia del pasado. Las memorias históricas de España (Barcelona: Galaxia Gutenberg; Círculo de Lectores, 2011), Rivista Storica Italiana 124 (2012) 810-817
Recensione di Stuart Schwartz, All Can Be Saved: Religious Tolerance and Salvation in the Iberian Atlantic World (New York; London: Yale University Press, 2008), E-Journal of Portuguese History 8, no. 1 (2010)
“Al servizio della corona. I vescovi portoghesi e la formazione dello Stato moderno,” Recensione di José Pedro Paiva, Os bispos de Portugal e do Império. 1495-1777 (Coimbra: Imprensa da Universidade, 2006). Studi Storici 48 (2007) 551-55
“Microstorie imperiali: l’odissea di Mazagão,” Recensione di Laurent Vidal, Mazagão, la ville qui traversa l’Atlantique : du Maroc à l’Amazonie, 1769-1783 (Paris: Aubier, 2005), Storica 33 (2005) 167-80
Recensione di José Adriano de Freitas Carvalho (ed.), Frei Marcos de Lisboa: Cronista Franciscano e Bispo do Porto. Actas do Colóquio (Porto: Faculdade de Letras, 2002). Rivista di storia e letteratura religiosa 40 (2004) 632-36
34 voci nel Dizionario storico dell’Inquisizione, diretto da Adriano Prosperi con la collaborazione di Vincenzo Lavenia e John Tedeschi (Pisa: Edizioni della Normale, 2010), 4 voll. (Abrunhosa, Gastão de; Barreiros, Gaspar; Battesimo forzato, Portogallo; Bugalho, Gil Vaz; Câmara, Martim Gonçalves da; Congiura di Beja; Coutinho, Fernando; Enrico, cardinale infante, poi re di Portogallo; Estradizione, Inquisizione iberiche; Fernandes, Isabel; Gesuiti, Portogallo; Inquisitori generali, Portogallo; Ledesma, Martín de; Luz, Valentim da; Malagrida, Gabriele; Mártires, Bartolomeu dos; Messianismo converso, Portogallo; Monache giudaizzanti di Coimbra; Moura, Manuel do Vale de; Parisio, Pietro Parisio; Porto (con J. P. Paiva); Quadros, Manuel de; Ribeiro, Jorge Gonçalves; Sá, Diogo de (con J. P. Paiva); Sá, Manuel de; Saavedra, Juan Pérez (con F. Soyer); Soares, João; Sousa, António; Sousa, Jerónimo de; Storiografia: Inquisizione portoghese; Struttura economica: Inquisizione portoghese (con A. I. López-Salazar Codes); Symmicta Lusitana; Tomar.